公元2035年，人类被12只猴子军研制的一种病毒侵袭，大部分人类都在这场病毒灾难中死亡，只有少数人侥幸逃生，但也只能在阴暗的地下，苟且偷生。　　科学家们决定派人穿越时光回到1996年追查12只猴子军的来历。囚徒詹姆斯·科尔(布鲁斯·威利斯 Bruce Willis 饰)被 挑选为志愿者。阴差阳错

1990年的9月24日，两位驾着F16战机的美国空军在伊拉克上空禁区做着例行飞行检查。出乎意料的，在北大西洋公约空域中出现了一架伊拉克喷射客机，李班宁机长（罗伯派屈克饰演）察觉这件意外后，准备赶这架偏离航道的飞机回正轨。约翰达克机长（鲁格豪尔饰演）则飞近这架客机想一探究竟，并向客机发出请求离去讯号。